CpG 아일랜드 탐색기는 게놈 DNA 상에서 5'-CG-3' 디뉴클레오티드가 비정상적으로 밀집된 영역(메틸화 억제 → 활성 프로모터)을 자동 탐지하는 도구입니다. Obs/Exp = (N_CpG × L) / (N_C × N_G) 수식 기반으로 슬라이딩 윈도우 스캔 + Gap<100 bp 병합 + 양방향 트리밍을 수행합니다. Gardiner-Garden 1987 (200bp / 50% GC / Obs-Exp > 0.6) 와 Takai-Jones 2002 (500bp / 55% / 0.65) 두 모드를 토글로 비교 가능.

(1) Housekeeping 유전자 프로모터 동정 (활성 발현 영역) (2) 암세포 과메틸화 candidate 영역 식별 (CpG 아일랜드의 hypermethylation) (3) Bisulfite sequencing / MSP primer 설계 영역 가시화 (4) Alu 반복서열 위양성 차단 (Takai-Jones 모드)

① DNA 염기서열 입력 (A/T/G/C, 200 bp 이상 권장) ② 모드 토글: • Gardiner-Garden 1987 (default, 범용) • Takai-Jones 2002 (인간 게놈 / Alu 차단) ③ Gap merge limit 슬라이더 (default 100 bp) ④ Load Example: GAPDH promoter (1+ island) / HBB promoter (0 island) ⑤ 출력: • Total GC% + 총 길이 • Islands 테이블 (start / end / 길이 / GC% / Obs-Exp / CpG count) • SVG 가로 트랙: 전 sequence 좌표 + island 하이라이트 블록 • 마우스오버 팝업 (start/end/GC%/Obs-Exp)

예 1) GAPDH promoter → Gardiner 모드 → 1 island 검출 → GC% ≈ 78%, Obs/Exp ≈ 0.92 예 2) HBB promoter → Gardiner 모드 → 0 island → GC% ≈ 48%, Obs/Exp 임계 미달 예 3) Takai-Jones 모드 → 동일 sequence를 더 엄격한 기준 (500bp/55%/0.65) 으로 재스캔 → Alu 위양성 제거